主訴檢察官辦理案件實行助手制。助手配備的多少以及主訴檢察官與其助手的關系結構，各地不盡相同。就組織形式看，有的屬于一主一助形成搭檔，有的則因一主二助而成為小組，有的則成立了主訴檢察官辦公室。就主訴檢察官的工作方式，尤其涉及與助手的關系上，應注意遵循兩項原則：

　　一是“主訴原則”。主訴檢察官的意義在于賦予直接參與程序的“一線檢察官”以更大的權力，如果不到一線，而當二掌柜，不直接辦案，也不出庭公訴，只是聽組內其他人匯報拍板，成了“小科長”，就喪失了改革的意義。高檢的實施方案要求主訴檢察官應當就承辦的案件出庭支持公訴，是很有必要的。一般情況下，不宜由助手獨立出庭；但就某些簡單案件，或者主訴檢察官因特殊原因不能到庭而助手又確能代替的，可以作例外情況允許助手獨立出庭。

　　二是“審訴統一”原則。主訴檢察官必須直接審查案件，如果不審查案件只是出庭，違背了訴訟的要求和司法的規律，這勢必導致不熟悉證據和事實，容易在庭上出問題。

　　此外，有的地方實行所謂“檢控分離”制，即由法律水平高、應變能力強的主訴檢察官面向法庭；讓實踐經驗比較豐富、有資歷且對公安比較熟悉的助手（事務檢察官）面對公安，指導公安取證。這種做法的好處在于各用其所長，也能調動助手的積極性。如果本院的情況適合，可以試行這種辦法。但如果主訴檢察官的助手年輕而缺少經驗且缺乏外部交往，這種辦法不一定可行。即使實行這種“檢控分離”，也應注意“分工而不分家”，主訴檢察官對其承辦案件的檢控負總括的責任。重要的偵查取證問題，主訴檢察官應當直接參與。在對某些復雜、爭議大、影響大的案件準備庭審時，主訴檢察官也需要主持或參與某些調查、詢問，以熟悉案情和證人，防止庭上意外情況的發生。