生藥學(xué)和中藥學(xué)均是以天然產(chǎn)物（植物為主、包括動(dòng)物和礦物類藥物)為研究對(duì)象，就像中醫(yī)與西醫(yī)診治的客觀主體都是人一般。正由于研究的對(duì)象基本相同，兩者的發(fā)展脈絡(luò)具有明顯的異同點(diǎn)。

　　一、博物而致知

　　生藥學(xué)和中藥學(xué)都具有博物學(xué)研究的特點(diǎn)，研究對(duì)象直接取材于廣闊的自然界，把動(dòng)植物資源當(dāng)作主要藥物原料進(jìn)行研究的學(xué)科。所以西方早期研究生藥的專家開(kāi)始多半是著名的博物學(xué)家（naturist）和醫(yī)學(xué)家，而且他們往往都是出色的植物學(xué)家。這與我國(guó)的中藥學(xué)家十分相似。
　　我國(guó)偉大的醫(yī)藥學(xué)家李時(shí)珍就是一位典型的博物科學(xué)家，他所建立的新藥物分類法（16綱60目），不僅系統(tǒng)地記錄了各種自然界的藥物知識(shí)，而且這個(gè)藥物系統(tǒng)很符合自然屬性與一些動(dòng)植物的進(jìn)化規(guī)律，如水菜類相當(dāng)于現(xiàn)代的藻類；芝（木而）類相當(dāng)于真菌類擔(dān)子菌綱。李時(shí)珍命名了“石油”，并且指出石油的產(chǎn)地有肅州、延州等地，與我國(guó)近代石油工業(yè)的誕生地基本相合。

　　二、中藥學(xué)與生藥學(xué)的區(qū)別

　　東西方科學(xué)研究的方法論不同，造成其宏觀研究與微觀研究的取向不同，這種區(qū)別可以說(shuō)是導(dǎo)致了中藥學(xué)和生藥學(xué)研究模式的不同。
　　1930年以來(lái)，毛細(xì)管分析法、比色法、分光光度計(jì)、熒光分析法和柱層析、紙層析逐漸成為生藥的基本鑒定方法；在藥物學(xué)研究方面，藥物作用強(qiáng)度（生物效價(jià)）之測(cè)定方法也得到迅速發(fā)展。至1960年后，紫外光譜、紅外光譜、薄層色譜、薄層色譜光密度法、氣相色譜、高效液相色譜、核磁共振、質(zhì)譜等現(xiàn)代儀器分析方法，以及高倍的電子顯微鏡、X射線衍射法、熱解薄層分析法（TAS）相繼問(wèn)世，生藥化學(xué)成分的分析、生藥超微結(jié)構(gòu)的鑒定、有效成分定性定量的測(cè)定逐漸成為生藥學(xué)研究的主流導(dǎo)向，即微觀方法在近一百年中占據(jù)了絕對(duì)統(tǒng)治的地位。

　　而中藥學(xué)又是走的怎樣的道路呢？
　　中藥的四氣五味、升降浮沉、引經(jīng)報(bào)使等理論是中醫(yī)藥學(xué)獨(dú)有的特色。其中，中藥的歸經(jīng)學(xué)說(shuō)在易水學(xué)派張?jiān)�素之前并沒(méi)有形成系統(tǒng)的理論，只是在零散的本草記載和個(gè)別醫(yī)家的經(jīng)驗(yàn)中收錄。另外還有李東垣、王好古等繼承和發(fā)揚(yáng)古湯液本草派的成就，以《內(nèi)經(jīng)》理論為源頭全新詮釋了“藥食同源”的中醫(yī)藥基本學(xué)術(shù)體系，構(gòu)建出了四時(shí)用藥、氣味理論、歸經(jīng)理論、引經(jīng)報(bào)使、升降浮沉、制方理論等重要的框架內(nèi)容，被后世一直沿用至今。明代李時(shí)珍在評(píng)價(jià)易水張?jiān)�素所開(kāi)創(chuàng)的中醫(yī)藥學(xué)成就時(shí)，稱其“大揚(yáng)醫(yī)理，《靈》《素》之下，一人而已”， 李氏本人也是把這些醫(yī)學(xué)理論實(shí)現(xiàn)藥物具體化的集大成式的人物。

　　因此，“醫(yī)藥合一”成為中醫(yī)學(xué)的根本特色之一；而民國(guó)之初，由于西學(xué)東漸，導(dǎo)致的那場(chǎng)“廢除中醫(yī)”運(yùn)動(dòng)中余云岫所主張的“廢醫(yī)存藥”的觀點(diǎn)，至今還在影響和左右著許多學(xué)者的認(rèn)識(shí)論和方法論。皮之不存，毛將安附？如果沒(méi)有中醫(yī)理論指導(dǎo)，會(huì)開(kāi)中藥的人就越來(lái)越少；假如沒(méi)有人會(huì)開(kāi)中藥，世界上就沒(méi)人知道中藥有效。所以說(shuō)，沒(méi)有了中醫(yī)理論指導(dǎo)的中藥研發(fā)，恐怕不能稱之為“中藥創(chuàng)新”！那么，要想真正創(chuàng)新，就必須走出醫(yī)藥兩分的暗區(qū)！

　　這里，我們是否還能從植物進(jìn)化之于醫(yī)藥學(xué)的影響，認(rèn)識(shí)和探討中藥治病的道理呢？植物比動(dòng)物至少早進(jìn)化2億年，因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)植物化石的最早紀(jì)錄要比動(dòng)物化石早。這可能就是為什么從植物中總能尋找到對(duì)抗人類新疾病的有效藥物的答案之一。植物不僅是人類氧氣（綠色植物的光合作用）和糧食的來(lái)源，而且是生態(tài)維護(hù)和防治水土流失的尖兵。植物還能夠抗污染、防輻射，對(duì)抗人類居處環(huán)境中不自然的或有害的因素，對(duì)抗人體的疾病和不健康狀態(tài)，從而起到保護(hù)大自然、保護(hù)人類的重要作用。可以說(shuō)植物為生命的源泉，因?yàn)樗�能從無(wú)機(jī)物合成有機(jī)物。而植物能夠有效調(diào)護(hù)人體健康的作用，正好被中國(guó)的醫(yī)藥學(xué)家所發(fā)現(xiàn)并延續(xù)發(fā)展了幾千年，成為了現(xiàn)在的中醫(yī)藥學(xué)。

　　三、論學(xué)科交*

　　西方20世紀(jì)前的“草藥學(xué)”歷來(lái)也有單方（Simplica）和復(fù)方（Compositae）之分。似乎列文虎克顯微鏡的發(fā)現(xiàn)，扭轉(zhuǎn)了西方生命科學(xué)的運(yùn)行軌跡。微觀研究已成為今天科學(xué)的主流。那么，宏觀研究的醫(yī)藥學(xué)陣地由誰(shuí)來(lái)堅(jiān)守呢？中藥復(fù)方的研究從何入手？由何突破呢？
　　當(dāng)今，學(xué)科的邊緣化已成為一種不可逆轉(zhuǎn)的趨勢(shì)。由于生物遺傳技術(shù)的發(fā)展，對(duì)經(jīng)濟(jì)價(jià)值較大的藥用作物進(jìn)行選種、雜交、嫁接，篩選優(yōu)質(zhì)品種和維持生藥品質(zhì)；利用人工方法促使植物遺傳因子的突變和多倍體植物的形成，利用示蹤原子探索有效成分在植物體內(nèi)形成過(guò)程和影響因素，研究次生代謝產(chǎn)物的起源和積累等，均已獲得進(jìn)展。由于植物化學(xué)成分知識(shí)的大量積累，針對(duì)各類植物的化學(xué)成分與其親緣關(guān)系的研究被稱為植物化學(xué)分類學(xué)（Plant Chemotaxonomy）。現(xiàn)代生藥學(xué)科已逐步擴(kuò)展成為包涵運(yùn)用植物化學(xué)、生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、植物生理學(xué)、遺傳學(xué)，以及資源植物學(xué)、生態(tài)地植物學(xué)等知識(shí)來(lái)研究探討天然藥物的來(lái)源、分類、資源開(kāi)發(fā)、遺傳育種、種質(zhì)優(yōu)勢(shì)、生產(chǎn)評(píng)價(jià)、生物合成、藥效藥理、毒理變化、微生物轉(zhuǎn)化等重要內(nèi)容的綜合性學(xué)科，而與有機(jī)化學(xué)和植物化學(xué)的關(guān)系最為緊密。
　　作為藥學(xué)的一個(gè)分支，生藥學(xué)與植物學(xué)就像一對(duì)孿生姐妹；而當(dāng)今天植物學(xué)的研究整體趨向于微觀化和化學(xué)，這也使得生藥學(xué)在發(fā)展方向上與醫(yī)學(xué)、特別是臨床醫(yī)學(xué)的距離越來(lái)越遠(yuǎn)。
　　總而言之，生藥學(xué)現(xiàn)代發(fā)展的一個(gè)前提，都是以有效化學(xué)成分研究為核心，在有效成分明確的條件下進(jìn)行的。而針對(duì)化學(xué)成分不明的有效藥物該怎樣認(rèn)識(shí)和研究呢？